Rencontre en ligne pour le projet CORAIL3D
[en ligne] Vendredi 23 octobre 2020Lien Jitsi de la réunion : ici
Prise de note de la réunion via Hackmd : ici
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CORAIL3D
Regards croisés Biologie, Ingénierie, Design
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> Une première journée au LAAS le 20/01/2020
> Qu’est ce qui s’est passé depuis , Quelles sont les pistes ?
> Informer, tous les participants des actions en cours
Discuter des nouvelles pistes
> Discuter de la méthode de travail
(Une ombrelle commune/une grappe de projets séparés)
Malgré l’urgence climatique
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> C’est un projet au long cours
> Il nous appartient à toutes et à tous
> Il peut aussi être propice à mettre à disposition les compétences du LAAS à vos propres problématiques de recherche ou de création
Programme
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> Présentation du contexte et de la première réunion
> Le projet Corail 3D
> Les pistes en cours de discussion
> Discussion Ouverte (tour de table)
« Ceci n’est pas un Corail. »
Donna Lophelia Plastica : vers une nouvelle taxonomie…
Piste en cours
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> Bibliothèque 3D des coraux : Projet financé par la fondation Dassault, (18 mois), début octobre 2020
Collections, Tomographie, Impression 3D, Plateforme numérique open-science, Exposition
Le projet Corail 3D a émergé suite à une journée d'étude organisée au LAAS-CNRS le 20/01/20.
Photographie prise lors de la JE Corail, restitution commune
Compte-rendu dessiné des différentes idées partagées durant la JE Corail
Il s'agit de faire vivre par l'expérience 3D une mémoire des coraux.
Nous avons commencé l'exploration de cette piste à partir des échantillons de coraux d'eau froide, Madrepora & Lophelia étudiés par Franck Lartaud (Arago, Banyuls-sur-mer).
Cartographie des acteurs
Coraux d'eau froide, laboratoire Arago, Banyuls-sur-mer, Franck Lartaud
Photographie : Elise Rigot
Principe de la tomographie à rayon X
Informations complémentaire : ici
Structures de coraux d'eau froide : Madrepora & Lophelia, extraits pile de radiographies Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse, IMFT, tout droit réservé
Reconstruction 3D d'une structure coraillienne par tomography 3D à rayon X Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse, IMFT, tout droit réservé
Reconstruction 3D d'une structure coraillienne par tomography 3D à rayon X
Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse, IMFT, tout droit réservé
Reconstruction 3D d'une structure coraillienne par tomography 3D à rayon X Résolution fichier .stl : 816x620x7451 px (résolution max : 1631x1240x1489 px)
Visualisation 3D par réalité virtuelle
Test réalisé à l'IRIT par Denis Tribouillois via Unity
Visualisation 3D par réalité virtuelle
Test réalisé à l'IRIT par Denis Tribouillois via Unity
Fichier volumique d'une structure de corail implémenté en WebGL sur navigateur web utilisant la carte graphique de l'usager (via Firefox)
Echantillons prêtés par le CRIOBE - Perpignan (Serge Planes) Nous avons identifié des espèces les plus morphologiquements diverses dans un premier temps
1.Une plateforme numérique en libre accès pour la communauté scientifique et les citoyens
2.La visualisation 3D des structures coralliennes
3. Une médiation scientifique de la bibliothèque à travers d'expositions artistiques
--> Archivage numérique du patrimoine biologique
--> Accès à des données structurelles sur le corail via la micro-tomographie à rayon X
-->Bibliothèque open-science bilingue : banque de données utilisable par la communauté scientifique et les citoyens
La bibliothèque 3D des coraux vise à archiver un patrimoine vivant dont la diversité s'érode à mesure des effets du réchauffement climatique. Il s'agit de produire un projet mêlant design & science avec d'un côté une bibliothèque en open-acess pensée pour fournir une base de données des structures coraliennes en 3D via la technologie du tomographe à rayon X, et de l'autre sa médiation auprès du public via une expérience en réalité virtuelle (VR) et la matérialisation de cette bibliothèque en utilisant l'impression 3D haute résolution et grand format. L'intention envers ce grand public est de raconter une autre histoire du corail, exploratoire, subtile, sans présager du sauvetage des récifs mais qui propose d'appréhender la diveristé des architectures de cet organisme batisseur.
Reconstruction par procédé d'impression 3D (SLA) d'une structure de Lophelia échelle 1
Tests réalisés au LAAS-CNRS par Julie Foncy via la DWS, Résine : DS3000
Reconstruction par procédé d'impression 3D (SLA) d'une structure de Lophelia échelle 2, éclairée par lampe UV
Tests réalisés au LAAS-CNRS par Julie Foncy via la DWS Résine : DS3000 (résine fluo)
Reconstruction par procédé d'impression 3D (SLA) d'une structure de Lophelia échelle 1 et 2 éclairées par lampe UV
Tests réalisés au LAAS-CNRS par Julie Foncy via la DWS Résine : DS3000 (résine fluo)
Pistes scientifiques évoquées
> Micro/Nano Tech pour l’étude de la culture Corallienne
Premières discussions: Etude de la métamorphose des planula, Supports nanostructurés pour l’étude en Spectro de masse des métabolites, étude du mechanosensing des plantula, Dispos Microfluidiques pour étude du micro-environnement chimique et de la sollicitation mécanique, Impression de biomatériaux de culture….
Pré Manip dès Oct 2020 puis élaboration d’un sujet de thèse et financement d’un projet ?
> Modèle de croissance des coraux :
Coraux d'eaux froides, colonies de coraux juvéniles, mise en place structurelle d’une colonie, calcification, suivi de croissance, modèle de croissance en 3 dimensions, micro-structuration du squelette
> Hydrodynamie des structures coralliennes :
en reproduisant les structures coralliennes en impression 3D + étude micro-fluidique
> Morphologie du corail rouge :
à travers une banque d’échantillons importante, comparer les scans & trouver les paramètres de croissance et les modéliser mathématiquement en 3D
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Tour de table : Positionnement, zones d'importance, points de vigilances, éléments pertinents à partager pour le projet
Prenons un temps pour échanger sur lms positionnements de chacun et des intérêts partagés dans ce projet qui croise Design, Technologie & Biologie.
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Méthode de travail
Comment souhaitons nous travailler ensemble ?